Após séculos de prática com bonsai, foram desenvolvidas ferramentas bem específicas para as diversas atividades relacionadas a esse cultivo. A maioria dessas ferramentas tiveram origem no Japão, mas, hoje, são comercializadas na maioria dos países do mundo. Porém, a qualidade e o preço de cada ferramenta varia muito. No Brasil, algumas delas têm equivalentes nacionais mais baratos. Para os iniciantes, não é necessária a compra de todas as ferramentas de uma só vez, mas apenas daquelas apropriadas às atividades básicas para cultivo e manutenção das plantas. É bom ter sempre em mente que a ferramenta mais importante é aquela inerente à pessoa que cultiva o bonsai, ou seja, a sua capacidade de transformar uma planta sem atrativos estéticos em uma "obra de arte".
De acordo com Vânia Moreira Fortes, coordenadora do Curso Arte e Técnica do Bonsai - Passo a Passo, elaborado pelo CPT - Centro de Produções Técnicas, as ferramentas e materiais básicos para a prática do bonsai são: